真空马桶，即将整个马桶系统制造成真空状态，在通向每个马桶的道上都会有一道隔离阀与系统隔离开来，当冲洗马桶时，此道阀便会打开，依靠于大气压间的压差，来清理马桶内的东西。
真空马桶系统带有真空泵，将系统整体制成真空状态，在通向每个马桶的道上都会有一道隔离阀将其与系统相隔。当冲马桶时，此道阀便会开启，这是依靠与大气压之间的压差，来清理马桶内的东西的。此套真空系统是依靠真空泵的自动运行来维持，较为复杂，尤其是马桶上的控制阀。
真空马桶系统组成结构包括冲洗按钮、供水增压器、清水箱、污水箱、排放阀、喷射器、中间槽、进水阀、控制器、冲水喷嘴等。
这套系统必须带有真空泵，将整个系统造成真空，系统通往每个马桶必须有一道隔离阀与系统隔离，当冲马桶时打开此道阀，依靠与大气压之间的压差，将马桶中的东西带走。真空系统是依靠真空泵自动运行保持的。这套系统比较复杂，尤其是马桶上的控制阀。这套系统的好处是省水。
一.节约用水。每次只需半加仑的水(约为2升的水\此水可以是飞机上使用的蓝色消毒液)，地面上使用的普通马桶、节水马桶，每次需要1.6加仑(6升)的水，老式马桶则需要5加仑(19升)的水。
二.真空马桶的下水道管径可制作得更为细致。
三.这种马桶朝向任何方向都可将脏东西带走，不像普通马桶非得朝下方向。如此一来，管道便可任意地铺设。
四.因管道可以随意铺设，所以在安装新马桶时也不需要将地板敲开。
六.真空马桶可以安装在房间的任何地方。
七.真空马桶可将大小便分离，大便径直进入肥料厂制成有机肥料，而小便、洗澡水和洗菜水之类的，都可以流入家门口的“人工小湿地”，待液体中的氮磷等营养成分被植物吸收之后，就可以得到供于景观的二类水。
