天然珍珠就是在偶然条件下所产生的一种珍珠，在外界受到刺激性作用使得细小杂质进入到某些贝类的外套膜内。此时，贝类软体为了保护自己而分泌出一种珍珠质，日久成珠。
天然珍珠与养殖珍珠相比里面的结构就是不同的，养殖的珍珠里面一般都是养殖人自己放进去的大的贝壳圆珠，而天然珍珠的里面一般都是小沙粒或者是寄生虫什么的，养殖的珍珠外面也就一层，而天然的珍珠外面包裹的比较多的，如果你想看里面的东西，那就需要剖开，天然珍珠里面的东西也是比较好发现的。养殖珍珠比天然珍珠要圆一些，这和它里面的构造有着很大的关系。天然珍珠是很细腻的，它的光泽也是很柔和的，而养殖珍珠养的时间一般都不会很长，所以会比较糙，透明度也没有那么好，当然光泽也肯定比天然的要差一些。
而如果我们用刀去刮成天然珍珠的话，他会刮下一层薄薄的珍珠粉。还有一种方法，我们就是要看一些珍珠的孔洞。天然珍珠的孔洞，他都是呈现出一种纹理性结构，而如果是人工珍珠的话，他的孔洞都会表面有一些皱纹。看起来非常的难看。如果我们用牙齿去咬珍珠的话，如果是人工珍珠或者是塑料真正的话咬起来会非常的光滑，你一般不会咬住他。而如果是天然珍珠的话，它的摩擦力会非常的大。都是你把两颗天然珍珠放在一起相互摩擦的话，它会发生一些摩差现象，并且会有一些响声。
随着时间的推移和研究的深入，越来越多的人认为颜色不同的珍珠必然含有不同的金属元素。金属元素的存在极为广泛，不论是淡水里，还是水中的生物，或是浮游生物微生物等都含有金属元素，由于环境的不同，珍珠贝也会吸收不同的金属元素，造成其内部的金属元素的不同，这样才导致形成了不同色彩的珍珠。根据研究证实发现，黄色系珍珠如金色等珍珠中含铜和银这类金属元素比较多，粉红色系等珍珠中则含有较多的钠和锌等金属元素，且不同颜色的珍珠所含有的金属元素的量也有差异。
